1、选择抗病性强树种，如日本落叶松。适地适树，大力营造混交林。加强幼林抚育，郁闭后及时修枝间伐。
2、每年6月末至7月初病菌子囊孢子飞散高峰期，在郁闭的林分施放百菌清或*杀菌烟剂，用量15公斤/公顷。要注意防火。施放烟剂时，参照落叶松枯梢病烟剂施放方法执行。也可用50%代森铵600倍，30%代森锌300倍液等喷雾防治。
3、人工措施：对落叶松林分采取透光抚育、清林等营林措施。在落叶后，及时集中落叶，深埋或烧毁。
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